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Western Blotting老踩坑?一篇搞定常见问题

人阅读 发布时间:2024-04-16 16:48

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Western Blotting实验失败缘由?

 

Western Blotting是生命科学研究的基础实验方法,实验中的蛋白量、抗体、凝胶、膜和检测反应等因素均可能导致实验失败,但初学者往往不知道原因所在。

“我不知道Western Blotting失败的原因是什么“

“我想知道解决方案!“

针对Western Blotting的各种问题,本文整理了在转膜、抗体反应、检测等过程中的常见问题及解决方案。

 

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Western Blotting常见的失败案例

以下为Western Blotting常见的失败案例:

 高背景

● 出现微笑条带或扭曲条带

 出现漫反射带

 转膜不均匀

下面将分别介绍它们的原因及相应的解决方案。

 

 

高背景

高背景.jpg

 

原因

解决方案

  洗涤不充分

  ● 增加洗涤次数

  ● 增加洗液体积

  ● 延长洗涤时间

  ● 确认Tween® 20 (*)浓度

  无法阻断非特异性结合

  ● 重新调节封闭温度和时间。室温下1 h,4℃下过夜

  ● 添加Tween® 20 (*)

  ● 使用添加Tween® 20 (*)的封闭缓冲液(TBS-TPBS-T

  ● 使用高灵敏度发光试剂(Immunostar® 系列

  膜处理不当

  ● 对膜进行必要的前处理

  ● 使用干净的镊子和手套,注意不要损坏膜。

  ● 孵育时振荡

  ● 使用低背景且可高灵敏度检测靶蛋白的CLEARTRANS® 系列产品

  因设备、器皿的污垢造成的污染

  ● 充分清洗转膜装置、电泳槽等设备,操作过程中佩戴手套

  强化学发光信号

  ● 缩短检测的曝光时间

  ● 缩短检测试剂的反应时间

  ● 降低检测试剂的浓度

(*) ICI Americans社的注册商标

 

出现微笑条带和扭曲条带

出现微笑条带和扭曲条带.jpg

 

原因

解決方案

  电压过高发热

  ● 降低电压进行电泳

  盐浓度不同

  ● 盐浓度越高,移动速度越快,需统一样品的盐浓度

  上样量不同

  ● 统一各个孔的上样量

  有空孔

  ● 在空孔中上样相同盐浓度、相同液量的样品,或仅上样样品缓冲液

 

 

出现漫反射带

出现漫反射带.jpg

 

原因 解决方案
  受到样品溶液中变性剂和表面活性剂的影响   ● 确认样品的提取和制备过程
  样品存放时间久,存储方法不当,导致蛋白降解   ● 确认样品的制备时间和存储方法
  转膜时间过短   ● 如果所有条带出现相同现象,可能是转膜时间短,需要延长转膜时间
  蛋白量过高   ● 调整蛋白上样量和浓度

 

 

转膜不均匀

转膜不均匀.jpg

 

原因

解决方案

  凝胶和膜之间有气泡

  ● 使用滚筒等去除气泡

  转膜设备的问题

  ● 使用半干式设备时,反复使用会导致转膜板弯曲,建议返厂维修或更换新的设备

  转膜方法的问题

  ● 半干式设备容易引起转膜不均匀的问题,可尝试更换为湿转仪

 

其他失败案例的原因及解决方案

 

其他的失败原因、解决方案如下所示。

● 条带模糊、不清晰

 条带空白

● 信号弱、无信号

● 背景有斑点和污渍

● 丽春红染色效果差

下面将分别介绍它们的原因及相应的解决方案

 

条带模糊、不清晰

 

原因

解決方案

  蛋白量过高

  ● 降低电泳的蛋白量

  抗体浓度高

  ● 降低一抗、二抗的浓度

  检测信号高

  ● 缩短曝光时间

  ● 缩短检测试剂的反应时间,反应后尽可能去除试剂

  ● 降低二抗浓度

 

条带空白

条带空白.jpg

 

原因

解決方案

  蛋白量高

  ● 减少蛋白量

  抗体浓度高

  ● 降低一抗、二抗的浓度

 

信号弱、无信号

 

  原因

解決方案

  抗体失活

  ● 检查抗体存储状态,时间

  ● 重新进行抗体反应时,推荐使用10 min即可去除抗体的“WB膜再生液

  抗体结合力不足

  ● 确认抗体的稀释浓度是否合适

  ● 延长抗体反应时间

  ● 对于低蛋白表达量的样品,可增加电泳量,提高抗体浓度

  ● 使用抗原抗体反应促进试剂

  ● 更换高效转膜缓冲液

  叠氮-化钠抑制酶反应

  ● 叠氮-化钠会抑制HRP的活性,因此抗体中含叠氮-化钠时,需要稀释抗体以降低叠氮-化钠浓度或使用不含叠氮-化钠的抗体

  ● 使用HRP标记一抗且阻断剂中含有叠氮-化钠时,需在封闭后使用 TBS-T清洗再进行抗体反应

  曝光时间短

  ● 延长曝光时间

  封闭时间不当

  ● 封闭时间过长时,封闭剂会遮盖抗原,降低抗体反应性,因此需要确认封闭时间是否合适

  转膜效率低,无法转膜

  ● 延长转膜时间

  ● 靶蛋白的分子量较高时(例:100 kD以上),添加0.1%的SDS(十二烷基硫酸钠)

  ● 使用预染蛋白Marker作为阳性对照,确认转膜效率

  ● 使用具有抗体结合位点的分子量Marker作为阳性对照

  检测试剂的化学发光弱

  ● 确认检测试剂是否变质

  ● 使用高灵敏度的发光试剂“ImmunoStar®系列

 

背景可见斑点和污渍

背景可见斑点和污渍.jpg

 

原因

解决方案

  镊子被污染

  ● 镊子上的污垢会附着在膜上形成背景。需使用经乙醇消毒后的干净镊子夹住膜的边缘

  洗涤不充分

  ● 加洗涤次数和洗液体积

  抗体反应不当

  ● 增加抗体反应溶液,并振荡使其反应

  检测设备被污染

  ● 检测前,使用乙醇擦拭放置膜的样品台,去除污垢

 

丽春红染色效果差

丽春红染色效果差.jpg

 

原因

解决方案

  蛋白未转膜

  ● 确认转膜设备是否正确运行

  ● 确认膜和凝胶是否正确接触

  低蛋白量

  ● 增加蛋白的上样量

  染色试剂变质

  ● 检查染色试剂的有效期

  ● 更换凝胶染色试剂(Negative Gel Stain MS KitPonceau 3RPonceau-3R Stain SolutionAmido Black 10B

 

 

Western blotting必备产品

 

  ● 封闭用脱脂奶粉

  ● 高效转膜液

  ● 预染蛋白Marker

  ● 抗原抗体反应加速试剂 Immuno-enhancer

  ● WB专用膜

  ● 过氧化物酶发光底物

必备产品.jpg

参考文献

● Rasheed Sule. et al. : Future Science., 75, 99 (2023)

 Habeebunnisa Begum. et al. : Future Science., 73, 58 (2022)

● 岡田雅人, 三木裕明, 宮崎香:「無敵のバイオテクにカルシリーズ 改訂第4版 タンパク質実験ノート 下」p.44 (羊土社)

● 西方敬人:「バイオ実験イラストレイテッド⑤」p.165 (秀潤社)

 

 

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